비상주 본점 법인이 창고를 따로 임차한 경우, 창고가 '사업장'이면 사업자등록 정정으로 추가하고 '하치장'이면 하치장 설치신고서를 10일 이내에 제출한다

쇼핑몰(스마트스토어·쿠팡 윙·자사몰)로 매출을 올리거나 소규모 제조·반조립 사업을 하는 법인이 창업 초기에 자주 선택하는 구조다. 본점은 비상주 사무실에 두고 월 2~5만원대 주소 비용만 쓰면서, 재고를 보관·발송할 공간은 외곽(인천·광주·김포·경기 외곽) 소형 창고를 월 20~80만원대로 따로 임차한다. 서울 중심지에 넓은 사무실을 쓰는 비용 대신, 사무실은 비상주로 비용을 눌러 두고 실제 자본은 재고와 창고에 넣는 방식이다.

문제는 세무·사업자등록 처리다. '본점은 비상주 주소니까 신고는 끝났고, 창고는 그냥 짐만 쌓는 곳이니 신고할 게 없다'고 생각하면 뒤에 세무조사나 하치장 미신고 가산세 통지로 돌아올 수 있다. 창고가 사업장인지 하치장인지에 따라 신고 서식·기한·지방세 범위가 달라지고, 임차료의 세금계산서·손금·매입세액 공제 처리까지 영향이 간다. 2026년 10월 기준으로 짚을 지점을 하나씩 정리한다(출처: 법제처 law.go.kr).

부가가치세법 시행령 제8조 제1항은 사업장을 '사업자가 사업을 하기 위하여 거래의 전부 또는 일부를 하는 고정된 장소'로 정의한다. 같은 조 제3항은 '재화를 보관하고 관리할 수 있는 시설만 갖춘 장소로서 하치장 설치신고서를 사업장 관할 세무서장에게 제출한 장소는 사업장으로 보지 아니한다'고 적는다. 두 조문을 묶으면 다음 기준이 나온다.

사업장에 가까운 경우 — 창고 안에서 다음 활동이 한 개라도 꾸준히 이뤄지는 경우: ① 주문 피킹·포장·송장 부착·택배 호출, ② 수입 통관 후 검수와 라벨링, ③ 조립·반조립·간단한 가공, ④ 반품 입고와 교환 처리, ⑤ 창고 상주 직원이 수주·발주 응대. 이런 활동이 있으면 창고 안에서 '거래의 일부'가 이뤄지는 것으로 보여 사업장으로 등록하는 쪽이 분쟁 소지를 줄인다.

하치장에 가까운 경우 — 창고가 다음에만 쓰이는 경우: ① 완제품·원재료 보관, ② 재고의 입고·반출만 운송사 또는 3PL이 수행, ③ 창고에 상주 인력이 없고 본점·사업장에서 모든 지시가 내려감, ④ 하치장을 '사업장이 아니라고' 명시적으로 세무서에 신고(하치장 설치신고서). 네 조건이 다 맞으면 하치장이다.

애매한 경우가 있다. 1인 법인 대표가 평일 낮에 혼자 창고에 들어가 주문 포장을 하고 저녁에 비상주 주소에서 사무 업무를 보는 식이면 창고 쪽이 사업장에 더 가깝다. 반대로 쿠팡 로켓그로스·마켓컬리 CFS 같은 3PL 창고에 재고를 넣고 피킹·배송을 3PL이 자기 사업으로 수행하면, 그 창고는 임차인(법인) 쪽에서 보면 사업장이 아니라 거래관계다. 이 경우에는 하치장 신고도 하지 않고 3PL 수수료만 손금으로 처리한다.

창고가 사업장에 해당한다고 판단하면 부가가치세법 제8조 제4항에 따라 사업 개시 전 또는 사업 개시 후 20일 이내에 사업자등록 정정신고를 낸다. 홈택스(hometax.go.kr)에 공동인증서로 접속해 신청/제출 → 사업자등록 신청/정정 → 사업자등록 정정 → 사업장(종된사업장) 추가 메뉴를 쓴다. 서면 신청은 본점 관할 세무서에 사업자등록 정정신고서를 제출한다.

제출 서류는 세무서별로 조금씩 다르지만 공통으로 쓰이는 것은 이렇다. 사업자등록 정정신고서, 임대차계약서 사본, 창고 현장 사진 2~3장(간판·내부·보관 상태), 사업장 평면도(간단한 손 그림도 가능), 간이 사업계획서(어떤 품목을 어느 규모로 보관·출하하는지 1쪽). 세무서는 통상 2~5영업일 안에 처리하고, 필요하면 담당자가 직접 전화나 서류 보완을 요구한다. '본점(비상주)에서 지시를 내리고 창고에서 포장·발송이 이뤄진다'는 설명을 1~2줄로 적어 두면 보완 통지에 빠르게 응답할 수 있다.

사업자등록번호는 통상 그대로 1개를 유지하고 사업장 코드만 분리된다. 세금계산서 발행 사업자번호는 하나로 유지되며, 사업장별 매출·매입은 전자세금계산서 발급 시 '공급받는자 사업장'·'공급하는자 사업장' 입력으로 구분한다. 신고 뒤 홈택스 '사업자등록증 재발급' 메뉴에서 종된사업장이 추가된 사업자등록증을 받아 임대인·거래처에 보내 둔다.

창고가 저장·보관만 하는 공간이면 하치장 설치신고서를 낸다. 부가가치세법 시행령 제8조 제4항은 '하치장을 둔 날부터 10일 이내에 하치장 설치신고서를 하치장 관할 세무서장에게 제출'하도록 정해 놓았다. 10일을 넘기면 하치장을 두고도 사업장으로 보는 결과가 되어 사업자등록 정정 의무가 되살아날 수 있다.

신고 방법은 홈택스에서 '신청/제출 → 하치장 설치신고'로 작성하거나, 하치장 설치신고서(부가가치세법 시행규칙 별지 서식)를 하치장 관할 세무서에 서면 제출한다. 하치장 관할 세무서가 사업장 관할 세무서(본점 관할)에 자동으로 통지하므로, 본점 관할에 따로 신고하지 않는다. 서식에는 하치장 명칭·소재지·설치일·보관 재화 종류를 적는다. 임대차계약서 사본이 함께 들어가면 처리가 빠르다.

하치장으로 등록되면 그 창고는 사업자등록상 사업장이 아니므로 지방세 사업소분(균등분·재산분·종업원분)도 창고 소재지에서는 과세되지 않는다. 다만 하치장은 '재화를 보관·관리할 수 있는 시설만 갖춘 장소'여야 하므로, 뒤에 창고에서 피킹·포장을 시작했다면 이번에는 사업자등록 정정으로 사업장 추가 신고를 다시 한다. 성격이 바뀌었는데 하치장 신고만 유지하면 세무조사 시 하치장 요건 결여로 소급해서 사업장으로 간주될 수 있다.

창고가 사업장이든 하치장이든 임차료의 손금·매입세액 공제 처리 원칙은 같다. 임대인이 사업자(개인·법인)면 세금계산서 발급 의무가 있고(부가가치세법 제32조), 법인은 세금계산서를 수취해 법인세법 제19조에 따라 손금 산입하고 부가가치세법 제38조에 따라 매입세액 공제를 받는다. 전자세금계산서는 홈택스에서 매월 수수하며, 발급 기한은 공급 시기가 속하는 달의 다음 달 10일까지다.

세금계산서를 못 받는 경우가 세 가지 있다. ① 임대인이 간이과세자인데 연 매출이 4,800만원 미만이면 세금계산서 발급 의무가 없다 — 이때는 임차료가 손금으로는 들어가지만 매입세액 공제는 안 된다. ② 임대인이 개인(비사업자)인데 창고를 '사적 임대'로 내준 경우 — 세금계산서가 없고 매입세액 공제도 안 된다. ③ 임대차계약서는 썼는데 임대인이 세금계산서 발급을 거부하는 경우 — 공급받은자가 매입자발행세금계산서(홈택스에서 신청)로 사후 발급받을 수 있다(부가가치세법 제34조의2). 계약 전에 임대인 사업자 유형과 세금계산서 발급 가능 여부를 확인해 두는 쪽이 뒤의 매입세액 분쟁을 줄인다.

보증금은 손금이 아니라 자산(장기대여금·보증금 자산 계정)으로 잡는다. 관리비·공과금(전기·수도)은 임대인이 세금계산서로 함께 발급하거나, 공과금은 공공요금 사업자(한전·수도사업소)에서 법인 명의 세금계산서로 직접 수취한다. 건당 3만원(부가세 포함)을 넘는 지출은 적격증빙(세금계산서·현금영수증·신용카드매출전표·지출증빙용 현금영수증) 중 하나를 받아 두는 쪽이 법인세법 시행령 제158조 제2항에 따라 적격증빙 미수취 가산세(2%)를 피할 수 있다.

창고에 재고가 쌓이기 시작하면 재고자산 평가 방법을 1가지 신고해 둔다. 법인세법 시행령 제74조 제1항은 다음을 열거한다: ① 원가법(개별법·선입선출법·후입선출법·총평균법·이동평균법·매출가격환원법), ② 저가법(장부가와 시가 중 낮은 금액). 어느 1가지를 선택해 신고하면 그 방법으로 결산한다.

신고 기한은 같은 조 제3항에 따라 사업연도 종료일부터 3개월 이내(법인세 신고기한)다. 신고하지 않으면 같은 조 제4항에 따라 선입선출법이 자동 적용된다. 쇼핑몰·소매업처럼 품목 수가 많고 단가가 자주 바뀌면 총평균법·이동평균법을 쓰는 경우가 많다. 보석·명품·고가 가전처럼 개별 단가 추적이 가능하면 개별법이 맞다. 제조업에서 원재료 가격 상승기에는 후입선출법이 과세이익을 눌러 주지만, 재고 흐름을 거꾸로 가정하기 때문에 외부감사·투자유치 시 설명이 어렵다는 점을 함께 고려한다.

평가 방법은 '한 번 신고하면 그 사업연도에는 못 바꾼다'. 변경하려면 변경하려는 사업연도 종료일 전 3개월 이내에 재고자산 평가 방법 변경신고서를 다시 낸다. 세무사와 결산 전에 재고 흐름·판매 방식·과세이익 영향을 시뮬레이션해 두면 신고 뒤 아쉬움이 적다. 평가 방법은 사업연도 결산에만 쓰이는 것이 아니라 외부감사·세무조사·투자유치 실사 때 전부 그 기준으로 설명해야 하므로, 한 번 결정하면 2~3년은 그대로 가는 쪽이 안전하다.

창고를 사업장으로 추가등록하면 지방세법 제74조부터 제83조까지의 사업소분 주민세가 창고 소재지 지자체에서 발생한다. 균등분(제81조)은 사업장별로 자본금·종업원 수에 따라 매년 5만~20만원 수준이고, 종업원분(제83조)은 월 평균 종업원 수가 50명을 넘으면 종업원 급여총액의 0.5%가 매월 과세된다. 재산분(제82조)은 매년 7월 1일 기준 사업장 연면적이 330㎡(약 100평)를 넘으면 1㎡당 250원이 적용된다. 소형 창고(100평 미만)에 종업원이 1~2명이면 재산분·종업원분은 발생하지 않고 균등분(사업장별 5만원)만 창고 지자체에 신고·납부한다.

2개 이상 지자체에 사업장이 있으면 사업장별로 신고한다(지방세법 제81조 제2항). 본점이 서울 비상주, 창고가 경기 외곽이면 서울·경기 두 지자체에 각각 균등분을 낸다. 신고 기한은 매년 8월 1일부터 8월 31일까지(지방세법 제83조 제4항), 납부는 신고와 동시에 한다. 위택스(wetax.go.kr)에서 지자체별 전자신고가 되고, 창고 지자체가 전자신고를 받지 않으면 창고 소재지 시·군·구청에 서면으로 간다.

하치장 신고로 처리된 창고는 사업장이 아니므로 창고 지자체에서 사업소분 주민세가 걸리지 않는다. 다만 본점(비상주) 소재지에서는 변함없이 균등분이 과세된다. 하치장을 두고도 과세고지서가 창고 지자체에서 날아왔다면 하치장 설치신고서 사본을 들고 지자체 세무과에 '사업자등록상 사업장이 아니다'를 소명한다.

비상주 본점 + 창고 조합에서 자주 보이는 실수를 묶어 둔다.

함정 1 — 창고를 '그냥 짐만 두는 곳'이라고 생각해 아무 신고도 안 한다. 실제로는 피킹·포장·검수를 하고 있으면 사업장이다. 세무조사 시 사업자등록 미등록으로 공급가액의 1%(부가가치세법 제60조 제1항) 가산세와 매입세액 공제 부인이 함께 걸릴 수 있다.

함정 2 — 임대인이 '세금계산서는 못 끊는다'고 해서 그냥 쓴다. 임대인이 사업자(일반과세자)인데 세금계산서를 발급하지 않으면 매입자발행세금계산서로 사후 발급받을 수 있다(부가가치세법 제34조의2). 처음부터 임대차계약서에 '월별 세금계산서 발급' 조항을 넣어 두는 쪽이 간단하다.

함정 3 — 재고 평가 방법을 신고하지 않고 결산한다. 신고하지 않으면 선입선출법이 자동 적용되는데(법인세법 시행령 제74조 제4항), 쇼핑몰·소매업처럼 품목 수가 많고 단가 변동이 큰 사업에서는 총평균법·이동평균법보다 과세이익이 커질 수 있다.

함정 4 — 하치장 신고를 10일을 넘겨서 낸다. 10일을 넘기면 하치장 신고 효력이 늦게 발생해 그 사이에 지방세·사업자등록 쪽에서 사업장으로 간주되는 결과가 생길 수 있다. 창고 임차 당일에 임대차계약서를 쓰고 다음 영업일에 홈택스나 세무서에 하치장 설치신고서를 올리는 흐름이 안전하다.

함정 5 — 사업자등록증 사업장 주소는 비상주 그대로 두고, 거래처에는 창고 주소만 알린다. 거래처가 세금계산서 '공급받는자 주소'에 창고 주소를 적으면 사업자등록 주소와 어긋나 매입세액 공제 자료 불일치가 뜬다. 사업자등록증 사본과 임대차계약서 사본을 함께 거래처에 돌리고, 세금계산서 발급 시 사업자등록상 사업장 주소를 '주된사업장'으로 쓰도록 안내한다.

창고를 임차하기 전 7가지 체크리스트: ① 창고에서 할 활동이 사업장과 하치장 어느 쪽에 가까운지 1~2줄로 적어 본다. ② 임대인 사업자 유형(일반·간이·비사업자)과 세금계산서 발급 가능 여부를 확인한다. ③ 임대차계약서에 공급가액·부가세 분리 표기와 월별 세금계산서 조항을 넣는다. ④ 창고 소재지 지자체의 사업장 등록·사업소분 세율을 미리 조회한다(위택스 wetax.go.kr). ⑤ 재고 평가 방법을 세무사와 1~2시간 상담해 1가지로 정한다. ⑥ 창고 보증보험(동산종합보험)을 재고 평가액 기준으로 설계한다. ⑦ 창고 상주 직원이 있으면 4대보험 사업장 성립신고를 창고 소재지 기준으로 할지, 본점(비상주) 소재지 기준으로 할지 공단에 사전 확인한다.

사례 1 — 쇼핑몰 법인(스마트스토어 + 자사몰). 서울 강남 비상주 사무실에 본점을 두고, 경기 김포에 15평 소형 창고를 월 50만원에 임차했다. 재고는 20여 품목 1,500개 수준, 상주 직원 1명이 피킹·포장·택배 호출을 담당한다. 창고에서 거래의 일부가 이뤄지므로 사업장으로 등록하는 쪽이 안전하다. 홈택스 사업자등록 정정 신청으로 창고를 종된사업장으로 추가하고, 재고 평가 방법은 총평균법으로 신고했다. 창고 지자체(김포시)에 균등분 5만원을 매년 8월에 신고·납부한다.

사례 2 — 소형 제조 법인(화장품 소분·라벨 부착). 서울 비상주 본점, 인천 외곽 20평 창고에 소분·라벨 부착 작업대를 설치했다. 완제품 라벨링이 창고에서 이뤄지므로 '제조업의 사업장은 최종제품을 완성하는 장소'(부가가치세법 시행령 제8조 제2항 제2호)에 해당해 사업장으로 등록한다. 균등분·종업원분·재산분까지 창고 지자체에서 발생할 수 있어 세무사와 소분 작업의 성격(제조에 해당하는지, 단순 포장에 가까운지)을 사전 확인한 뒤 추가등록한다.

사례 3 — 3PL(제3자 물류) 활용 법인(쿠팡 로켓그로스·마켓컬리 CFS). 서울 비상주 본점에 재고를 쿠팡 창고에 입고하고 피킹·배송은 쿠팡이 자기 사업으로 한다. 쿠팡 창고는 코워크시티 입장에서 보면 임차 사업장이 아니라 '거래관계'다. 쿠팡 수수료는 세금계산서로 받아 손금·매입세액 공제를 처리하고, 사업자등록 정정이나 하치장 설치신고는 필요 없다. 다만 자사몰 재고를 조금이라도 자체 창고에서 보관하면 그 창고는 하치장 신고 대상이 될 수 있다.

비상주 본점 + 창고 조합의 실무는 사업자등록·세무·지방세·물류 전반과 이어진다. 심화 자료 몇 개를 묶어 둔다.

[비상주 사무실 사업자등록·세무]
· 비상주 사무실 사업자등록 되는 곳 — 위치별 요건·절차·체크리스트 2026 →
· 비상주 사무실 임대료 부가세 공제받는 법: 세금계산서·매입세액 5단계 2026 →
· 비상주 사무실 국세청 실사 대응 5단계 — 실질사업장 판정·사업자등록 취소 리스크 완벽 가이드 2026 →

[비상주 사무실 지방세·관리]
· 비상주 사무실 법인 지방세·주민세 신고 완벽 가이드 2026 — 사업소분 균등분·재산분·종업원분·지방소득세 1%p 인상 반영 5단계 →

[본점·사업장·창고 구조 설계]
· 법인 본점·사업장·창고 3중 분리 운영 가이드 - 절세 + 운영 효율 →

[비상주 사무실 종합]
· 비상주 사무실 종합 가이드 2026 →

비상주 사무실 입주와 창고 임차를 함께 설계하는 상담은 /apply →에서 접수한다. 코워크시티 법인설립지원센터는 비상주 사무실 입주확인서 발급과 사업자등록 신청 안내만 담당하고, 사업자등록 정정·하치장 설치신고·재고 평가 방법 선택·지방세 신고 같은 세무 판단은 제휴 세무법인이 각자 수행한다. 창고 임대차계약 자체는 임차인과 임대인의 영역이므로 코워크시티가 창고 알선·중개를 수행하지 않는다.

본 글은 2026년 10월 기준의 정보 제공용이다. 부가가치세법 시행령·법인세법 시행령·지방세법은 매년 개정되고, 사업장·하치장 판단은 세무서별 재량이 있어 개별 사안은 세무사·공인회계사와 사전 상담을 권한다. 창고 임차 전에 임대인 사업자 유형과 세금계산서 발급 가능 여부를 함께 확인하는 쪽이 매입세액 분쟁을 줄인다.

출처: 법제처 국가법령정보센터 law.go.kr(부가가치세법 제8조·제32조·제34조의2·제38조·제60조·시행령 제8조·시행규칙 하치장 설치신고 서식·법인세법 제19조·시행령 제74조·제158조·지방세법 제74조·제81조·제82조·제83조) · 국세청 nts.go.kr(사업자등록 안내·업종코드) · 국세청 홈택스 hometax.go.kr(사업자등록 정정·하치장 설치신고·전자세금계산서) · 행정안전부 위택스 wetax.go.kr(지방세 사업소분 신고)